意大利一位历史学家帕拉蒂科提出，达芬奇的母亲或许是来自东方的奴隶，因为达芬奇在生活以及工作中的一些细节，都显示出与东方国家存在着某种联系，例如达芬奇写字是从右往左写，这与我国古代书写习惯颇为相似，并且《蒙娜丽莎》中的背景与我国山水画的风格也十分相像，弗洛伊德也曾提出，《蒙娜丽莎》的背景是中国风的景观。
关于画中女子身份的第三种猜测，说他是达芬奇的一位男学生，名叫萨拉伊，萨拉伊是一位优雅俊美的青年，有着一头浓密的卷发，据说他曾在达芬奇家中偷过5次钱，然而达芬奇还是让他在自己家里住了25年，还将他培养成一名艺术家，并且达芬奇的晚年作品中有很多人物都与萨拉伊极为相似，这不仅让人们怀疑萨拉伊不仅是他的学生，更像是他的爱人。
有研究人员表明，萨拉伊就是达芬奇创作《蒙娜丽莎》的模特，并指出鼻子与嘴巴等细节极度相似，还有人将《蒙娜丽莎》名字中的字母重新排一个顺序，翻译出来就是法语中的“我的萨拉伊”，巧合的是，《蒙娜丽莎》这幅作品也是达芬奇在法国时期完成创作的。
《蒙娜丽莎》中的诸多细节让人细思极恐，画中女子的表情一直以来有着不小的争议，有人认为她是在微笑，有人认为她的表情很严肃，对此，哈佛医学院的一名神经生物学家进行了解释。据她分析，人在观察别人时一般注视的都是眼睛，所以欣赏这幅画作时也是这样，《蒙娜丽莎》的微笑之所以会发生变化，是因为观察者的视线在其脸上进行了游动，其实这幅画中隐藏的细节还有很多。
意大利一位艺术史专家文塞提用高倍放大镜对《蒙娜丽莎》进行观察时惊讶地发现，画中女子的右眼瞳孔中竟然隐藏着“LV”的字样，有人认为这代表的是达芬奇名字的缩写，还有一个细节是画中女子并没有眉毛，有人认为这是达芬奇为了人脸能达到黄金分割比例，所以才故意没画眉毛。也有人说，当时贵妇美容的习惯就是割掉眉毛，所以才没有画。
对此，一位法国工程师声称自己揭开了秘密，他用高清相机拍下《蒙娜丽莎》，将照片放大到24倍以后，发现在女子左眉的位置上有一道勾勒眉毛的印记，不过为何将眉毛画的如此隐晦，目前还没有确切答案。年法国科学家帕斯卡尔科特，说出了一个让人十分震惊的消息，那就是《蒙娜丽莎》中还隐藏着另一个女人，而她才是画作的真正主角，她利用光反射技术对蒙娜丽莎进行了扫描，结果发现这幅画作曾进行过几次改版，它是由4幅画像叠加而来，第一层是草稿，其他三层都是肖像画。
其中第三层画像上能够清晰地看到眉毛、睫毛以及酒窝，这与书中记载的蒙娜丽莎真实相貌十分相像，所以帕斯卡尔科特认为，第三层的肖像画才是蒙娜丽莎的真正主人，也就是前面提到的富商夫人丽莎。不过丽莎一直没有收到这幅画作，而达芬奇则一直在这幅画作上进行创作，直至形成我们如今看到的第四层肖像画。那么你认为这第四层肖像画中的女人究竟是谁呢？是他怀念的母亲，还是他心爱的徒弟呢？
